Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5U6

ZCCHC4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC4Q9H5U6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC4Q9H5U6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC4Q9H5U6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC4Q9H5U6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC4Q9H5U6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC4Q9H5U6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC4Q9H5U6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC4Q9H5U6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC4Q9H5U6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms