Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RWDD1Q9H446 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RWDD1Q9H446 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RWDD1Q9H446 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RWDD1Q9H446 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RWDD1Q9H446 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RWDD1Q9H446 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RWDD1Q9H446 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RWDD1Q9H446 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RWDD1Q9H446 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RWDD1Q9H446 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms