Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD1Q9H3U5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MFSD1Q9H3U5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MFSD1Q9H3U5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD1Q9H3U5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms