Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R2

MUC13, Mucin-13, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC13Q9H3R2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MUC13Q9H3R2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MUC13Q9H3R2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MUC13Q9H3R2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC13Q9H3R2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms