Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2B2

SYT4, Synaptotagmin-4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT4Q9H2B2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT4Q9H2B2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT4Q9H2B2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT4Q9H2B2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT4Q9H2B2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT4Q9H2B2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT4Q9H2B2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT4Q9H2B2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT4Q9H2B2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT4Q9H2B2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT4Q9H2B2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT4Q9H2B2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT4Q9H2B2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT4Q9H2B2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT4Q9H2B2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT4Q9H2B2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms