Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Z9

TSPAN10, Tetraspanin-10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN10Q9H1Z9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN10Q9H1Z9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN10Q9H1Z9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN10Q9H1Z9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN10Q9H1Z9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN10Q9H1Z9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms