Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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XRN2Q9H0D6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 45.1
XRN2Q9H0D6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 45.1
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XRN2Q9H0D6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 45.1
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XRN2Q9H0D6 AATK-AS1-201ENST00000414089 1577 ntTSL 220.73■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 45.1
XRN2Q9H0D6 MUS81-213ENST00000530928 1793 ntTSL 220.67■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 45.1
XRN2Q9H0D6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 45.1
XRN2Q9H0D6 MUS81-202ENST00000524647 1817 ntTSL 518.86■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 45.1
XRN2Q9H0D6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 45.1
XRN2Q9H0D6 BRD4-210ENST00000601941 604 ntTSL 513.04□□□□□ -0.326e-15■■■■■ 45.1
XRN2Q9H0D6 MUS81-214ENST00000531905 3420 ntTSL 511.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 45.1
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XRN2Q9H0D6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.096e-15■■■■■ 44.9
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