Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV7

HAPLN2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN2Q9GZV7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HAPLN2Q9GZV7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HAPLN2Q9GZV7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HAPLN2Q9GZV7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HAPLN2Q9GZV7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms