Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCOLN1Q9GZU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCOLN1Q9GZU1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCOLN1Q9GZU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCOLN1Q9GZU1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MCOLN1Q9GZU1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms