Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTR3CQ9C0K3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3CQ9C0K3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR3CQ9C0K3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms