Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRTQ9BXP5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRRTQ9BXP5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRRTQ9BXP5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRRTQ9BXP5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms