Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBS2Q9BXC9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBS2Q9BXC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BBS2Q9BXC9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms