Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
HIRIP3Q9BW71 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
HIRIP3Q9BW71 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
HIRIP3Q9BW71 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HIRIP3Q9BW71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HIRIP3Q9BW71 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HIRIP3Q9BW71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms