Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMED9Q9BVK6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED9Q9BVK6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED9Q9BVK6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms