Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP23Q9BRU9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
UTP23Q9BRU9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTP23Q9BRU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP23Q9BRU9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP23Q9BRU9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms