Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22CQ9BRL7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22CQ9BRL7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEC22CQ9BRL7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms