Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms