Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TREX2Q9BQ50 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TREX2Q9BQ50 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREX2Q9BQ50 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms