Protein–RNA interactions for Protein: Q99808

SLC29A1, Equilibrative nucleoside transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A1Q99808 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC29A1Q99808 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC29A1Q99808 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC29A1Q99808 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC29A1Q99808 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC29A1Q99808 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC29A1Q99808 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC29A1Q99808 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC29A1Q99808 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC29A1Q99808 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms