Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A3Q99624 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A3Q99624 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms