Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP4Q99569 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP4Q99569 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP4Q99569 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP4Q99569 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms