Protein–RNA interactions for Protein: Q99527

GPER1, G-protein coupled estrogen receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPER1Q99527 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPER1Q99527 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPER1Q99527 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPER1Q99527 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms