Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK5RAP2Q96SN8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK5RAP2Q96SN8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK5RAP2Q96SN8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK5RAP2Q96SN8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK5RAP2Q96SN8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK5RAP2Q96SN8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms