Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPK1Q96SB4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPK1Q96SB4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPK1Q96SB4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPK1Q96SB4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPK1Q96SB4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPK1Q96SB4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPK1Q96SB4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPK1Q96SB4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRPK1Q96SB4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRPK1Q96SB4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPK1Q96SB4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms