Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NODALQ96S42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NODALQ96S42 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NODALQ96S42 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms