Protein–RNA interactions for Protein: Q96QI5

HS3ST6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST6Q96QI5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST6Q96QI5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST6Q96QI5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS3ST6Q96QI5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS3ST6Q96QI5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms