Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNAQ96QF7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCNAQ96QF7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCNAQ96QF7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNAQ96QF7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms