Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP3Q96P47 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP3Q96P47 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP3Q96P47 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms