Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF558Q96NG5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF558Q96NG5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF558Q96NG5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF558Q96NG5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF558Q96NG5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF558Q96NG5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF558Q96NG5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms