Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNOT6LQ96LI5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNOT6LQ96LI5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNOT6LQ96LI5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNOT6LQ96LI5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNOT6LQ96LI5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNOT6LQ96LI5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNOT6LQ96LI5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNOT6LQ96LI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNOT6LQ96LI5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms