Protein–RNA interactions for Protein: Q96K19

RNF170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170Q96K19 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF170Q96K19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF170Q96K19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF170Q96K19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF170Q96K19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF170Q96K19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms