Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SERAC1Q96JX3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SERAC1Q96JX3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SERAC1Q96JX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SERAC1Q96JX3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms