Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM3Q96HU1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SGSM3Q96HU1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGSM3Q96HU1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGSM3Q96HU1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms