Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ACSBG1Q96GR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ACSBG1Q96GR2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ACSBG1Q96GR2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ACSBG1Q96GR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ACSBG1Q96GR2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ACSBG1Q96GR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ACSBG1Q96GR2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ACSBG1Q96GR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ACSBG1Q96GR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ACSBG1Q96GR2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ACSBG1Q96GR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ACSBG1Q96GR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ACSBG1Q96GR2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ACSBG1Q96GR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ACSBG1Q96GR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ACSBG1Q96GR2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ACSBG1Q96GR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ACSBG1Q96GR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ACSBG1Q96GR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms