Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX27Q96GQ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX27Q96GQ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX27Q96GQ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX27Q96GQ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX27Q96GQ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms