Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23CQ96ET8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23CQ96ET8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23CQ96ET8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms