Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHFRQ96EP1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHFRQ96EP1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHFRQ96EP1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHFRQ96EP1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
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