Protein–RNA interactions for Protein: Q96EN9

C19orf60, Uncharacterized protein C19orf60, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf60Q96EN9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C19orf60Q96EN9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf60Q96EN9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C19orf60Q96EN9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf60Q96EN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms