Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM19Q96E16 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM19Q96E16 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM19Q96E16 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms