Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPUSD4Q96CM3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD4Q96CM3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPUSD4Q96CM3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPUSD4Q96CM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms