Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF21AQ96BD5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21AQ96BD5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHF21AQ96BD5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms