Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC8Q96B26 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC8Q96B26 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC8Q96B26 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC8Q96B26 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC8Q96B26 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC8Q96B26 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EXOSC8Q96B26 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC8Q96B26 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC8Q96B26 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC8Q96B26 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC8Q96B26 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC8Q96B26 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC8Q96B26 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC8Q96B26 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC8Q96B26 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC8Q96B26 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC8Q96B26 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC8Q96B26 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms