Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NELL1Q92832 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NELL1Q92832 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NELL1Q92832 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NELL1Q92832 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NELL1Q92832 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NELL1Q92832 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NELL1Q92832 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NELL1Q92832 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELL1Q92832 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELL1Q92832 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NELL1Q92832 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms