Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA1Q92743 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTRA1Q92743 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms