Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
TOPBP1Q92547 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC44.29■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
TOPBP1Q92547 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC44.19■■■■■ 4.67
TOPBP1Q92547 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
TOPBP1Q92547 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
TOPBP1Q92547 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
TOPBP1Q92547 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC44■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.98■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
TOPBP1Q92547 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms