Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
ABCA10Q8WWZ4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
ABCA10Q8WWZ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
ABCA10Q8WWZ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
ABCA10Q8WWZ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
ABCA10Q8WWZ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
ABCA10Q8WWZ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ABCA10Q8WWZ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCA10Q8WWZ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
ABCA10Q8WWZ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ABCA10Q8WWZ4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ABCA10Q8WWZ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCA10Q8WWZ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCA10Q8WWZ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCA10Q8WWZ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCA10Q8WWZ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCA10Q8WWZ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.13■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
ABCA10Q8WWZ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ABCA10Q8WWZ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
ABCA10Q8WWZ4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCA10Q8WWZ4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCA10Q8WWZ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms