Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP33Q8TEY7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP33Q8TEY7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP33Q8TEY7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP33Q8TEY7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP33Q8TEY7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms