Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDD1Q8TEB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDD1Q8TEB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHBDD1Q8TEB9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDD1Q8TEB9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms