Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HELQQ8TDG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HELQQ8TDG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELQQ8TDG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELQQ8TDG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms