Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB92

HMGCLL1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLL1Q8TB92 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGCLL1Q8TB92 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGCLL1Q8TB92 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGCLL1Q8TB92 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGCLL1Q8TB92 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGCLL1Q8TB92 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGCLL1Q8TB92 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGCLL1Q8TB92 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGCLL1Q8TB92 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCLL1Q8TB92 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGCLL1Q8TB92 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms